口腔溃疡的发生通常与多种因素有关，一般认为约20% - 30%的人可能因遗传因素易患口腔溃疡，若家族中有多人反复长口腔溃疡，那么其本人患口腔溃疡的几率相对较高。
局部创伤因素
口腔内机械刺激： 比如牙齿的残冠、残根，或者不合适的假牙等，它们会不断摩擦口腔黏膜，从而引发口腔溃疡。例如，长期存在的锐利牙尖，可能在进食或说话时持续刺激口腔黏膜，经过一段时间后就容易导致局部出现溃疡。咬伤口腔黏膜： 不小心咬到口腔内侧、舌头等部位，也会形成创伤性口腔溃疡。比如吃饭时速度过快，或者在嬉笑打闹中咬伤口腔，若没有及时恢复，就可能发展为溃疡。
免疫系统因素
免疫力下降时易发病： 当人体免疫力降低时，比如感冒、过度劳累、睡眠严重不足等情况下，口腔内原本潜伏的病毒或细菌等就容易活跃起来，引发口腔溃疡。像一些人在连续熬夜加班后，就可能出现口腔溃疡，这就是因为免疫力暂时下降，使得口腔的防御能力减弱。自身免疫性疾病关联： 某些自身免疫性疾病也可能与口腔溃疡相关，比如白塞病，患者除了反复口腔溃疡外，还可能出现眼部病变、生殖器溃疡等症状。这种疾病是由于自身免疫系统错误地攻击自身组织导致的。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 尤其是维生素B族（如B2、B6、B12等）和维生素C缺乏时，容易引发口腔溃疡。例如，长期挑食、节食的人，很容易出现维生素摄入不足的情况，进而增加患口腔溃疡的风险。有研究表明，缺乏维生素B2会影响黏膜的正常代谢，使口腔黏膜容易受损而发生溃疡。微量元素缺乏： 锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体多种酶的合成和代谢，缺铁会影响血红蛋白的合成，进而影响身体的正常功能，当这些微量元素缺乏时，口腔黏膜的修复能力下降，就容易长口腔溃疡。比如孕妇如果缺乏锌元素，就可能更容易出现口腔溃疡的情况。