甲状腺激素低通常称为甲状腺功能减退，其原因有多种。比如自身免疫性疾病，像慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本病），这是最常见的导致甲状腺激素低的原因之一，约占自身免疫性甲状腺炎患者中甲状腺功能减退的90%左右。
一、自身免疫因素相关
自身免疫性甲状腺炎： 除了桥本病，还有萎缩性甲状腺炎等自身免疫性疾病也会攻击甲状腺，影响甲状腺激素的合成与分泌，进而导致甲状腺激素低。患者往往会有自身抗体升高的情况，比如甲状腺过氧化物酶抗体等。遗传因素影响： 某些遗传因素也可能增加自身免疫性甲状腺疾病的发生风险，从而间接导致甲状腺激素低。有家族中有自身免疫性甲状腺疾病患者的人群，相对来说患甲状腺激素低的概率可能会比一般人群高一些。
二、甲状腺破坏相关
放射性治疗： 比如甲亢患者接受放射性碘治疗后，碘辐射可能会破坏甲状腺组织，使甲状腺合成甲状腺激素的能力下降，一般在治疗后的几个月到几年内可能会逐渐出现甲状腺激素低的情况。通常在放射性碘治疗后的6 - 12个月左右，部分患者就可能出现甲状腺功能减退的表现。手术切除： 因甲状腺结节、甲状腺癌等疾病进行甲状腺部分或全部切除手术后，剩余的甲状腺组织如果不能满足身体对甲状腺激素的需求，就会导致甲状腺激素低。手术切除甲状腺组织的比例不同，出现甲状腺激素低的时间和程度也有所不同。
三、碘摄入异常相关
碘缺乏： 当人体长期处于碘摄入不足的状态时，会影响甲状腺激素的合成原料，从而导致甲状腺激素低。比如在一些远离海洋且土壤、食物中碘含量较低的地区，居民长期碘摄入不足，就容易出现甲状腺激素低的情况。一般人群每日碘的适宜摄入量成人约为150微克，儿童和孕妇等有特殊需求的人群摄入量会有所不同，若长期低于适宜摄入量就可能引发问题。碘过量： 虽然相对少见，但长期大量摄入碘也可能影响甲状腺功能，导致甲状腺激素低。比如长期服用含碘药物（如胺碘酮等），或者食用过多含碘丰富的食物（如大量海带等），都可能干扰甲状腺激素的正常代谢，引起甲状腺激素低。