口里长溃疡的原因有多种。一般来说，大约有20% - 30%的复发性阿弗他溃疡与遗传因素有关，如果家族中有多人经常长口腔溃疡，那么其他人患病风险相对较高。
局部创伤因素
口腔咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就容易形成溃疡，这种情况在进食速度快或者注意力不集中时较常见。尖锐牙尖刺激： 口腔内如果有龋坏后未及时修复的锐利牙尖，长期摩擦口腔黏膜，也会导致溃疡反复出现，这种情况可能会持续刺激，溃疡不容易愈合。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 当身体缺乏维生素B₂、维生素B₁₂等时，容易引发口腔溃疡。例如，长期吃素的人，如果饮食搭配不合理，就可能出现维生素摄入不足的情况，进而增加长溃疡的几率。一般来说，正常成年人每天需要摄入维生素B₂约1.2 - 1.5毫克，维生素B₁₂约2.4微克。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体多种代谢过程，缺乏锌时会影响细胞的正常分裂和修复，从而容易长溃疡。正常成年人每天锌的适宜摄入量男性约15.5毫克，女性约11.5毫克。
免疫系统因素
自身免疫性疾病： 如白塞病，这是一种全身性免疫系统疾病，可以累及口腔、眼睛、生殖器等多个部位，口腔内会反复出现溃疡，同时可能伴有眼部炎症、生殖器溃疡等表现。免疫力低下： 当人体免疫力低下时，比如患有艾滋病、长期服用免疫抑制剂等情况，口腔容易受到病原体侵袭，引发溃疡。例如，艾滋病患者由于免疫系统被破坏，口腔内更容易出现各种感染性溃疡，且愈合困难。