月经干净后有褐色分泌物通常不宜同房，否则可能导致交叉感染，对患者健康不利。一般来说，出现这种情况可能由以下原因导致，且可采取相应治疗措施：
一、月经未结束。月经干净后有褐色分泌物，可能是月经其实并未真正结束，只是经量明显减少。此时不仅要避免同房，还需注意个人卫生，以防感染。
二、阴道炎。可能因病原体感染阴道而引起，会出现月经干净后有褐色分泌物的现象。此时同房易发生交叉感染，可在医生指导下使用如甲硝唑片、替硝唑片等药物进行治疗。
三、盆腔炎。大多是由于阴道内的细菌上行感染盆腔导致，也会有褐色分泌物。这种情况同样要避免同房，可遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星、盐酸克林霉素胶囊等药物进行治疗。
总之，当月经干净后出现褐色分泌物时，要重视起来，明确原因并及时进行相应处理，同时避免同房以保障自身健康。