孕初期孕酮低与以下因素有关：胚胎发育不好、黄体酮功能不全、甲状腺功能失调。
一、胚胎发育不好：孕妇怀孕后，若精子和卵子质量欠佳，会导致胚胎在孕妇腹中发育不理想，进而存在流产风险，此时孕酮往往会降低。这种情况下需要在医生指导下服用黄体酮来进行保胎。比如，胚胎自身存在染色体异常等问题，就会影响其正常发育，从而引起孕酮水平下降。
二、黄体酮功能不全：女性怀孕后可能出现黄体异常，这会直接影响孕酮含量，致使孕酮降低。遇到此种情况必须前往医院进行医治。具体来说，黄体生成素分泌不足或者黄体过早衰退等，都可能引发黄体酮功能不全，进而导致孕酮降低。
三、甲状腺功能失调：孕妇甲状腺功能失调后会出现孕酮降低的情况，并且在孕妇体内还会产生胰岛素抗体，这种抗体也会使孕酮发生变化。当发生这种情况时，一定要尽快去医院治疗。比如，甲状腺功能减退时，会影响机体的代谢，从而可能引起孕酮水平的异常。
总之，孕初期孕酮低可能是由多种原因导致的，需要及时就医，明确具体原因并采取相应的治疗措施。