怀孕初期孕酮低的原因主要有以下几点：
1.黄体功能不全：怀孕初期，卵巢分泌的孕激素主要是黄体分泌的，黄体功能不全就会导致孕激素分泌不足，从而出现孕酮低的情况。
2.肾上腺、甲状腺功能严重失调：肾上腺、甲状腺功能严重失调，会影响卵巢功能，导致排卵异常、孕激素分泌减少，出现孕酮低的情况。
3.胎儿发育异常：如果胎儿发育异常，也会导致孕酮低。
4.其他：孕妇本身患有疾病，如糖尿病、高血压等，也会影响孕酮的分泌。
治疗方法：
1.一般治疗：如果孕酮值只是稍微偏低，可以通过饮食和休息进行调节。多吃一些富含孕激素的食物，如大豆、豆腐等；注意休息，避免过度劳累。
2.药物治疗：如果孕酮值偏低比较严重，需要在医生的指导下服用孕激素类药物进行治疗，如黄体酮胶囊、地屈孕酮片等。
需要注意的是，孕酮低可能会导致先兆流产、胎停育等不良后果，因此一旦发现孕酮低，应及时就医，在医生的指导下进行治疗。同时，在治疗期间，孕妇应注意卧床休息，避免剧烈运动和性生活。