急性肺栓塞的治疗需根据患者具体情况采取综合措施，一般来说，治疗主要包括一般处理与呼吸循环支持治疗、溶栓治疗、抗凝治疗等。通常确诊急性肺栓塞后会尽快启动治疗，部分患者在规范治疗下可改善预后。
一般处理与呼吸循环支持
监测生命体征： 要密切监测患者的呼吸、心率、血压、血氧饱和度等生命体征，及时了解病情变化。比如持续监测血氧饱和度，若低于90%需采取相应措施。呼吸支持： 对于有低氧血症的患者，可根据情况采用鼻导管或面罩吸氧，严重时可能需要机械通气来维持正常的呼吸功能。
溶栓治疗
适用情况： 对于高危肺栓塞患者，也就是那些有明显呼吸困难、胸痛、低血压等表现的患者，通常会考虑溶栓治疗。一般在确诊后尽快进行，最好在14天内进行，能有效溶解血栓，改善症状。常用溶栓药物： 常用的有尿激酶、链激酶、重组组织型纤溶酶原激活剂（rt-PA）等。这些药物可以激活体内的纤溶系统，溶解血栓。
抗凝治疗
基础抗凝药物： 普通肝素是常用的抗凝药物之一，通过抑制凝血因子发挥作用。低分子肝素也是常用的，它的抗凝效果相对稳定，出血风险相对普通肝素有所降低。长期抗凝： 一般在溶栓治疗后需要长期口服抗凝药物，如华法林，不过需要监测国际标准化比值（INR）来调整剂量；新型口服抗凝药如利伐沙班等也可使用，它们不需要频繁监测INR，但价格可能相对较高。
手术治疗
肺动脉血栓摘除术： 这种手术适用于病情非常严重、溶栓等治疗无效的高危肺栓塞患者。但手术风险较高，需要严格评估患者的身体状况等因素。导管碎解和抽吸血栓： 对于一些合适的患者，可以通过导管将血栓碎解并抽吸出来，改善肺动脉的血流情况，但也有一定的适应证和操作要求。