多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，一般认为是遗传与环境因素共同作用导致。据研究，约60% - 70%的患者存在遗传易感性。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性成员患病的风险会增加。比如，母亲患有多囊卵巢综合征，其女儿患病的几率比正常人群高出2 - 4倍。这是因为某些特定的基因变异可能会传递给后代，影响内分泌和代谢功能。基因相关影响： 已发现一些与激素合成、代谢以及卵巢功能调控相关的基因，可能在多囊卵巢综合征的发病中起到作用。例如，与胰岛素抵抗相关的基因变异，会增加患多囊卵巢综合征的可能性。
内分泌失调方面
下丘脑 - 垂体功能异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率异常，会导致垂体分泌的促黄体生成素（LH）水平升高，促卵泡生成素（FSH）水平相对降低，LH/FSH比值大于2 - 3。这种激素比例失衡会影响卵巢的正常排卵功能，使得卵巢难以排出成熟卵子。胰岛素抵抗因素： 约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗。即身体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症又会刺激卵巢分泌过多雄激素，进一步加重排卵障碍和其他症状，如多毛、痤疮等。
环境因素方面
饮食与生活方式： 长期高热量、高脂肪饮食，缺乏运动，会增加患多囊卵巢综合征的风险。比如，长期摄入过多油炸食品、甜食等，容易导致体重增加，而肥胖是多囊卵巢综合征的重要危险因素之一。体重超标会进一步加重胰岛素抵抗和内分泌紊乱。外界压力影响： 长期精神压力过大，会通过神经内分泌系统影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能。例如，长期处于紧张、焦虑状态下，可能会导致激素分泌失衡，诱发或加重多囊卵巢综合征的症状。