多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，可能与遗传因素、内分泌失调以及生活方式等多方面有关。据研究，遗传因素在其中起到重要作用，如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性患病风险会增加约5-10倍。
遗传因素影响
基因遗传倾向： 多囊卵巢综合征具有一定的家族聚集性，多个基因的变异可能与该病的发生相关。比如某些与胰岛素抵抗、性激素合成相关的基因发生突变或异常表达时，就容易引发多囊卵巢综合征。如果家族中母亲或姐妹患有此病，女性自身患病概率比正常人群要高不少。染色体异常关联： 部分患者存在染色体结构或数目异常情况，例如X染色体数目或结构的改变等，也可能导致多囊卵巢综合征的发生。
内分泌失调因素
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节失常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素和垂体分泌的促性腺激素失衡，会使得卵巢产生过多雄激素，进而干扰正常的排卵功能。垂体分泌的促黄体生成素（LH）与促卵泡生成素（FSH）比例失调，正常情况下FSH与LH比例约为1 - 2，而患者体内往往LH水平升高，FSH相对不足，影响卵泡的正常发育和排卵。胰岛素抵抗影响： 约有50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗现象。胰岛素抵抗会导致机体代偿性分泌过多胰岛素，进而刺激卵巢间质和卵泡膜细胞增生，合成更多雄激素，同时还会影响肝脏性激素结合球蛋白的合成，使游离雄激素增多，进一步加重内分泌紊乱，影响排卵等正常生理过程。
生活方式因素
饮食不规律： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会导致体重增加，而肥胖又是引发多囊卵巢综合征的重要危险因素之一。比如长期大量摄入油炸食品、甜品等，会使身体代谢紊乱，影响激素水平。有研究表明，体重超重5%以上的女性，患多囊卵巢综合征的风险会明显升高。缺乏运动： 长期缺乏体育锻炼，身体代谢减慢，也容易出现胰岛素抵抗等问题，从而增加患多囊卵巢综合征的几率。如果每周运动时间少于3次，每次运动时长不足30分钟，身体代谢功能下降，就更易诱发该病。长期精神压力大： 长期处于高压力状态下，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常功能，导致激素分泌紊乱。例如长期熬夜、精神紧张焦虑等，会使内分泌失调，增加多囊卵巢综合征的发病风险。