口腔长期溃疡可能由多种原因引起。一般来说，口腔长期溃疡超过两周仍未愈合就需要重视。
一、缺乏营养物质
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B2、维生素B12等时，容易引发口腔长期溃疡。比如长期偏食、节食的人，很可能摄入维生素不足，据统计，约有30% - 50%的复发性口腔溃疡患者存在维生素B2水平偏低的情况。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔长期溃疡有关。例如锌元素参与人体多种酶的合成，缺乏锌时，会影响细胞的正常分裂和修复，使得口腔黏膜的修复能力下降，增加口腔溃疡长期不愈的风险。
二、免疫系统问题
自身免疫性疾病： 某些自身免疫性疾病会累及口腔黏膜，导致长期溃疡。比如白塞病，这是一种全身性免疫系统疾病，口腔内会反复出现溃疡，还可能伴有眼部、生殖器等部位的病变。患者的免疫系统会错误地攻击自身组织，使得口腔黏膜持续受损。免疫功能低下： 当人体免疫功能低下时，如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的人，口腔容易受到病原体侵袭，且修复能力减弱，从而出现长期溃疡。例如长期使用糖皮质激素的患者，其免疫功能被抑制，口腔黏膜抵御外界刺激和自我修复的能力降低，容易发生长期溃疡。
三、局部刺激因素
牙齿残根残冠： 口腔内如果有锐利的牙齿残根、残冠，会持续摩擦口腔黏膜，长时间刺激就会导致局部长期溃疡。比如有尖锐边缘的牙齿残根，会不断刮擦对应的口腔黏膜部位，使黏膜反复受损，难以愈合。不良修复体： 不合适的假牙等修复体，也会对口腔黏膜造成慢性刺激。例如假牙边缘不贴合、过紧或过松，都会反复摩擦口腔组织，引发长期溃疡。有些患者佩戴假牙后，口腔内相应部位会经常出现溃疡，就是因为修复体刺激所致。