非经期褐色分泌物腰疼可能是排卵期出血、妇科炎症、节育环、内分泌紊乱等原因引起的。以下是可能的原因和治疗方法：
1.排卵期出血：如果非经期褐色分泌物出现在两次月经中间，量少，可能是排卵期出血。这是由于排卵期雌激素水平下降，部分子宫内膜脱落引起的，一般不需要治疗，注意休息和保暖即可。
2.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等，可能会导致非经期褐色分泌物，同时伴有腰疼、下腹坠胀等不适。需要进行妇科检查、白带常规、B超等检查，明确病因后进行针对性治疗，如使用抗生素、栓剂、物理治疗等。
3.节育环：如果放置了节育环，也可能出现非经期褐色分泌物腰疼的情况。这可能是节育环刺激子宫内膜引起的，一般不需要特殊处理，如果症状严重，可以考虑取环或更换节育环。
4.内分泌紊乱：如黄体功能不足、多囊卵巢综合征等，可能导致内分泌紊乱，引起非经期褐色分泌物和腰疼。治疗方法包括补充孕激素、调整月经周期、促排卵等，需要根据具体情况进行治疗。
5.其他原因：子宫内膜息肉、子宫肌瘤、宫颈癌、子宫内膜癌等也可能引起非经期褐色分泌物腰疼，需要进行进一步的检查和治疗。
总之，非经期褐色分泌物腰疼可能是多种原因引起的，如果持续出现或伴有其他不适症状，应及时就医，明确病因后进行针对性治疗。同时，注意个人卫生，保持外阴清洁，避免过度劳累和精神压力。