眼睛有滤泡是否能自愈需具体分析原因。如果是因眼睛过度疲劳导致，有自愈可能；若因结膜炎引起，则不会自行痊愈。
一、因用眼过度、眼睛疲劳导致眼睛有滤泡时，若采用热蒸汽湿敷或熏蒸促进眼部淋巴循环，这种情况可能自愈。
1.用眼过度会使眼睛出现滤泡。
2.通过特定方法可促进恢复。
二、若滤泡是由滤泡性结膜炎导致，即眼结膜受细菌或病毒感染，结膜组织出现滤泡形成，此时滤泡不会自行痊愈。
1.滤泡性结膜炎会造成滤泡且不能自愈。
2.应配合相应治疗，如使用阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦凝胶、普拉洛芬滴眼液等药物，严重时可请专业医生进行滤泡刮除，否则可能形成睑结膜瘢痕化，引发严重干眼症，导致后续治疗更棘手。
总之，眼睛有滤泡能否自愈，要根据具体情况来判断。