脑积水通常是由多种原因引起的。比如先天性因素，胎儿在发育过程中，约有2%-5%的胎儿可能存在脑脊液循环通路先天性异常，从而引发脑积水；还有颅内感染，像细菌性脑膜炎、结核性脑膜炎等疾病，在发病后的1-2周内，炎症可能会导致脑脊液循环通道粘连、堵塞，进而引起脑积水；另外，颅内出血也是常见原因之一，尤其是新生儿颅内出血，如早产儿脑室周围 - 脑室内出血，血液可能会阻塞脑脊液的正常循环通路，导致脑积水发生。
先天性因素导致
神经管发育异常： 在胚胎发育早期，神经管闭合过程出现障碍，会影响脑脊液的正常生成和循环结构的发育。例如，胚胎在妊娠22-28天左右神经管闭合时，如果受到遗传因素、母体缺乏叶酸等影响，就可能出现神经管发育畸形，使得脑脊液循环的通路先天性狭窄或阻塞，为脑积水的发生埋下隐患。遗传因素影响： 某些单基因遗传病可能与脑积水的发生相关，有家族遗传倾向的家庭中，后代患先天性脑积水的概率相对较高。研究发现，一些特定基因的突变会干扰脑脊液的正常代谢和循环过程，增加脑积水发病风险。
颅内感染引发
细菌性脑膜炎： 当细菌感染脑膜后，会引起脑膜的炎症反应，导致脑脊液分泌增多，同时炎症产生的脓性分泌物容易粘连蛛网膜颗粒等结构，而蛛网膜颗粒是脑脊液回吸收的重要部位，一旦粘连阻塞，脑脊液回吸收受阻，就会使脑室系统内脑脊液积聚，逐渐形成脑积水。一般在细菌性脑膜炎发病后的1-2周内，就可能观察到脑室系统进行性扩大的情况。结核性脑膜炎： 结核杆菌感染脑膜后，会引发慢性炎症，炎症过程中会产生肉芽组织，这些肉芽组织容易堵塞脑脊液的循环通道，如第四脑室出口等部位。随着病情进展，脑脊液循环受阻越来越严重，脑室逐渐扩张，从而导致脑积水。而且结核性脑膜炎病程较长，脑积水的形成可能是一个逐渐发展的过程。
颅内出血所致
新生儿颅内出血： 早产儿由于脑血管发育不完善，容易发生脑室周围 - 脑室内出血。血液积聚在脑室内，会阻塞脑脊液的循环通路，影响脑脊液的正常流动和吸收。据统计，早产儿脑室周围 - 脑室内出血的患儿中，约有30%-40%会逐渐发展为脑积水。另外，足月新生儿产伤导致的颅内出血，如硬膜下出血等，血液如果积聚在颅内压迫脑脊液循环通道，也可能引发脑积水。外伤性颅内出血： 头部受到外伤后，颅内血管破裂出血，血液在颅内形成血肿，血肿可能会压迫脑脊液的循环途径，使得脑脊液不能正常循环和吸收，进而引起脑积水。比如严重的颅脑外伤导致蛛网膜下腔出血，血液凝固后可能粘连阻塞蛛网膜颗粒，影响脑脊液回吸收，最终导致脑积水发生。