胃肠功能紊乱时，可使用调节胃肠动力、改善消化功能等药物来缓解症状，比如常用的有多潘立酮、曲美布汀等，但具体用药需根据个体情况，一般来说合理用药能在一定程度上改善症状。
调节胃肠动力类药物
多潘立酮： 属于外周多巴胺受体阻滞剂，能促进胃肠蠕动，加快胃排空，可缓解腹胀、恶心、呕吐等症状，适用于因胃肠动力不足引起的胃肠功能紊乱。但需要注意，严重肾功能不全者要慎用。莫沙必利： 也是促进胃肠动力的药物，通过兴奋5-羟色胺受体，增强胃肠道蠕动，改善消化不良、早饱、上腹胀等症状。不过，对莫沙必利过敏者禁用。
调节消化功能类药物
消化酶制剂： 像复方消化酶胶囊，里面含有多种消化酶，能促进食物的消化吸收，改善因消化功能弱导致的胃肠功能紊乱，可用于伴有消化不良症状的胃肠功能紊乱患者。但急性胰腺炎早期患者禁用。乳酸菌素片： 能在肠道形成保护层，阻止病原菌、病毒的侵袭，还能刺激肠道分泌抗体，提高肠道免疫力，促进有益菌生长，调节肠道菌群，改善胃肠功能。一般来说安全性较好，但对乳酸菌素过敏者禁用。
调节精神心理类药物
氟哌噻吨美利曲辛片： 如果胃肠功能紊乱是由精神心理因素引起，比如长期焦虑、抑郁等导致的，该药物可以调节患者的精神状态，从而改善胃肠功能。不过，严重心脏疾病、闭角型青光眼患者禁用。需要注意的是，儿童不建议使用该药物。帕罗西汀： 属于抗抑郁药，对于伴有明显抑郁情绪的胃肠功能紊乱患者，使用帕罗西汀等抗抑郁药物，在改善情绪的同时，也可能有助于胃肠功能的恢复，但用药时要密切关注药物的不良反应，比如可能会引起恶心、口干等不适，而且孕妇、哺乳期妇女使用需谨慎，儿童使用要特别评估。