肝内胆管结石的症状表现多样，部分患者可能长期无症状，而有些患者会出现上腹部疼痛等情况，约有1/3的患者可能间断出现上腹部隐痛，有时还会有胀痛感。
疼痛症状表现
右上腹隐痛： 肝内胆管结石可能导致右上腹出现间断性的隐痛，这种疼痛可能在进食油腻食物后加重。比如一些患者在饱餐或者食用油炸食品后，右上腹隐痛会比平时更明显。胆绞痛： 少数患者会出现胆绞痛，疼痛较为剧烈，可向右肩或背部放射，这是因为结石移动刺激胆管引起痉挛所致。一般疼痛会持续一段时间，然后可能逐渐缓解。
消化道症状表现
消化不良： 患者可能会有消化不良的表现，如食欲减退、腹胀等。大约有半数左右的肝内胆管结石患者会出现不同程度的消化不良症状，吃了东西后感觉上腹部饱胀不适。恶心呕吐： 当结石引起胆管梗阻等情况时，可能会引发恶心、呕吐，尤其是在疼痛发作时，呕吐可能会随之而来，但呕吐后症状不一定能完全缓解。
黄疸表现
轻度黄疸： 部分患者会出现黄疸，表现为皮肤和巩膜轻度黄染。这是因为结石堵塞胆管，影响胆汁排泄，胆红素反流入血导致的。一般黄疸程度相对较轻，有时可能只是皮肤稍微有点发黄，巩膜轻度染黄。黄疸波动： 黄疸的程度可能会有波动，当结石位置有变化，胆管暂时疏通时，黄疸可能会减轻，但如果结石又堵塞胆管，黄疸会再次出现。
发热表现
低热： 当肝内胆管结石引发胆道感染时，患者可能会出现低热，体温一般在37.5℃~38℃左右。这是因为胆道感染导致炎症反应，身体出现发热的应激表现。高热寒战： 严重的胆道感染时，患者可能会出现高热，体温可达39℃以上，同时伴有寒战，这是比较严重的感染情况，需要及时就医处理。