新生儿败血症主要是由细菌感染引起的，大约有1% - 10%的新生儿可能会发生败血症。
母体因素导致
孕期感染： 如果孕妇在孕期有泌尿系统感染、绒毛膜羊膜炎等情况，细菌可能通过胎盘感染胎儿。比如孕妇孕期发生了严重的泌尿系统感染，没有及时治疗，细菌就有可能通过血液循环影响到子宫内的胎儿，增加新生儿患败血症的风险。产程感染： 产程延长、胎膜早破等情况也容易让细菌侵入。例如胎膜早破超过12小时，新生儿在通过产道时就更容易接触到细菌，从而引发败血症。
新生儿自身因素
皮肤黏膜屏障弱： 新生儿的皮肤、黏膜比较娇嫩，容易破损，细菌容易侵入。比如新生儿的脐部如果护理不当，细菌就可能从脐部进入血液引发感染。免疫系统不完善： 新生儿的免疫系统尚未发育成熟，中性粒细胞游走和吞噬功能较差，血清免疫球蛋白（尤其是IgM、IgG）含量低，杀菌能力不足，容易导致细菌在体内繁殖引发败血症。例如早产儿的免疫系统比足月儿更不完善，发生败血症的几率相对更高。
医源性因素
侵入性操作： 新生儿接受气管插管、脐血管穿刺、导尿等侵入性操作时，如果操作过程中消毒不严格，就会把细菌带入体内引发感染。比如在进行脐血管穿刺时，没有严格遵循无菌操作流程，就可能让细菌进入血液导致败血症。住院环境因素： 新生儿病房如果消毒不彻底，或者医护人员手部卫生不达标，也可能导致新生儿感染细菌引发败血症。例如新生儿病房的空气消毒不及时，空气中的细菌可能会接触到新生儿，增加患病风险。