胃肠感冒主要是由病毒感染引起的，其中最常见的是柯萨奇病毒，同时也可能伴有细菌混合感染。一般来说，机体免疫力下降时更容易被病毒侵袭从而引发胃肠感冒。
病毒感染是主因
柯萨奇病毒感染： 柯萨奇病毒是引发胃肠感冒的常见病毒之一，它可以通过呼吸道飞沫传播或者接触被污染的物品传播。当人体抵抗力下降时，柯萨奇病毒就容易侵入消化道和呼吸道，从而引起胃肠感冒相关症状，比如恶心、呕吐、腹泻等。其他病毒感染： 像埃可病毒等也可能导致胃肠感冒。这些病毒同样会借助空气、接触等途径进入人体，影响胃肠道功能，引发不适症状。
机体免疫力因素
儿童群体： 儿童的免疫系统尚未完全发育成熟，相比成年人更容易出现免疫力低下的情况。例如，3岁以下的幼儿，自身抵抗力较弱，在接触到病毒等病原体时，就更易患上胃肠感冒。老年人： 老年人随着年龄增长，身体各项机能衰退，免疫力也会逐渐下降。60岁以上的老年人，由于免疫功能减弱，对病毒的抵御能力降低，也较容易受到胃肠感冒病毒的侵袭。疲劳状态下： 长期熬夜、过度劳累会使人体免疫力降低。比如连续加班熬夜一周后，身体处于疲劳状态，此时感染胃肠感冒病毒的几率就会明显增加。
环境因素影响
气温变化： 当气温在短时间内大幅下降时，人体的呼吸道和胃肠道容易受到刺激。例如，在季节交替时，气温从20℃左右骤降到10℃以下，人体没有及时添加衣物保暖，就可能引发胃肠感冒。空气污染： 空气中存在大量的病菌、粉尘等污染物时，会增加感染风险。在雾霾天气里，空气中的有害颗粒较多，人们吸入后可能影响呼吸道和胃肠道健康，诱发胃肠感冒。