甲状腺功能亢进如果控制不佳，可能引发多种潜在并发症。据临床数据显示，约有10% - 20%的甲状腺功能亢进患者会出现相关并发症。
心血管系统并发症
心房颤动： 甲状腺功能亢进会使心脏负担加重，容易引发心房颤动。患者可能会感到心悸、心跳不规则等，长期的心房颤动还可能增加脑卒中的风险。心力衰竭： 长期甲状腺功能亢进未得到有效控制，心脏长期处于高动力状态，容易导致心力衰竭。患者会出现呼吸困难、乏力、水肿等症状，严重影响生活质量。
骨骼系统并发症
骨质疏松： 甲状腺功能亢进会加速骨的吸收，导致骨量丢失，增加骨质疏松的发生风险。患者可能会出现腰背疼痛、身高变矮等表现，骨折的可能性也会增加。近端肌病： 部分甲状腺功能亢进患者会出现近端肌病，表现为肢体近端肌肉无力，上下楼梯、蹲下站起困难等，会影响日常活动能力。
眼部并发症
浸润性突眼： 约5% - 10%的甲状腺功能亢进患者会出现浸润性突眼，眼睛会有明显的异物感、畏光、流泪、视力下降等症状，严重时可导致角膜溃疡、失明等。非浸润性突眼： 也称为良性突眼，患者主要表现为眼球轻度突出，眼裂增宽等，但一般症状相对较轻，通过积极治疗甲状腺功能亢进，部分症状可缓解。
甲状腺危象
发病急骤： 甲状腺危象是甲状腺功能亢进最严重的并发症之一，多发生于未积极治疗或治疗不充分的患者。通常在感染、手术、创伤等应激情况下诱发。症状严重： 患者会出现高热（体温可达39℃以上）、大汗淋漓、心动过速（心率常超过140次/分）、烦躁不安、谵妄甚至昏迷等症状，若不及时抢救，死亡率较高。