怀孕初期上厕所有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：在怀孕初期，褐色分泌物可能是先兆流产的迹象。这可能是由于胚胎染色体异常、母体激素分泌不足、子宫畸形等原因引起的。孕妇可能会出现阵发性下腹痛或腰背痛，伴有阴道少量流血，血色可呈鲜红色或暗红色，有血凝块。此时需要及时就医，医生一般会建议进行超声检查、孕激素水平测定等，以明确诊断。如果是先兆流产，医生可能会建议卧床休息、使用孕激素等保胎治疗。如果保胎治疗失败，可能会发展为难免流产。
2.异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，俗称宫外孕。宫外孕时，胚胎发育不良，随着胚胎的生长，绒毛侵蚀子宫肌层，导致子宫肌层破裂，引起阴道出血。宫外孕是一种非常危险的情况，可能会导致大出血、休克等严重后果。如果怀孕初期出现腹痛、阴道出血等症状，应及时就医，进行超声检查等，以明确是否为异位妊娠。一旦确诊异位妊娠，应尽早进行治疗，可选择手术治疗或药物治疗。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜局部增生，逐渐向外突出形成的赘生物。息肉质地脆弱，血管丰富，容易因接触而发生出血。怀孕后，由于激素水平的变化，宫颈息肉可能会增大，导致阴道出血。一般出血量较少，色鲜红，可在医生的指导下进行息肉摘除术。
4.其他：葡萄胎、胎盘前置状态、胎盘早剥等也可能导致怀孕初期阴道出血。
如果怀孕初期上厕所有褐色分泌物，建议及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情舒畅，按时产检。