胆管结石的治疗方法需根据病情等因素决定，一般来说，无症状的胆管结石可定期观察，而有症状或并发症的胆管结石多需手术等治疗。
手术治疗方式
腹腔镜胆管切开取石术：这是比较常用的手术方式，通过在腹部做几个小切口，插入腹腔镜和手术器械，切开胆管取出结石。这种手术创伤相对较小，恢复较快，一般术后住院时间在7~10天左右。开腹胆管切开取石术：对于一些病情复杂、腹腔镜手术难以完成的情况会采用开腹手术，直接切开胆管取出结石。但开腹手术创伤大，恢复时间相对较长，可能需要10~14天甚至更久才能基本恢复。
内镜下治疗
内镜逆行胰胆管造影（ERCP）取石：通过口腔、食管、胃到达十二指肠，找到胆管开口，插入导管至胆管内，注入造影剂显示胆管结石情况，然后用取石网篮等工具取出结石。这种方法适用于部分胆管结石患者，尤其适合一些身体状况较差不能耐受手术的患者。一般术后需要住院观察1~3天。内镜下鼻胆管引流术（ENBD）：如果胆管结石伴有胆管炎等情况，可能先通过ENBD引流胆管内的胆汁，减轻炎症，为后续治疗创造条件。
药物辅助治疗
抗生素：当胆管结石引起胆管炎时，需要使用抗生素来控制感染，常用的有头孢菌素类等抗生素，一般需要根据细菌培养和药敏试验选择合适的抗生素，使用时间通常根据病情严重程度而定，可能需要3~7天甚至更长时间。熊去氧胆酸：对于一些较小的胆固醇结石，在医生评估后可能会使用熊去氧胆酸等药物辅助治疗，希望能促进结石的溶解，但一般疗程较长，可能需要数月甚至半年以上，而且并不是所有患者都有效。