上呼吸道感染约有70%~80%由病毒引起，常见的病毒包括鼻病毒、冠状病毒、流感病毒等；细菌感染约占20%~30%，像溶血性链球菌、肺炎链球菌等是常见的致病菌。
病毒因素导致
鼻病毒引发：鼻病毒是引起普通感冒最常见的病原体之一，它很喜欢在鼻腔等上呼吸道部位“安家”，能让人体出现鼻塞、流涕、打喷嚏等症状，全年都可能活跃，尤其在秋冬季节更容易引发上呼吸道感染。流感病毒作祟：流感病毒分为甲、乙、丙三型，其中甲型流感病毒易发生变异，传染性强，感染后往往起病急，会导致高热、头痛、全身酸痛等较明显的全身症状，还伴有上呼吸道感染的相关表现，一般冬春季高发。
细菌因素导致
溶血性链球菌感染：溶血性链球菌可引起急性扁桃体炎，患者会出现咽痛、扁桃体红肿，有时还能看到脓性分泌物，严重的可能伴有发热等全身症状，这种细菌感染在劳累、受凉等机体抵抗力下降时容易侵袭人体引发上呼吸道感染。肺炎链球菌感染：肺炎链球菌可导致肺炎、中耳炎等并发症，当它引发上呼吸道感染时，也会有发热、咳嗽、咽痛等表现，儿童和老年人等抵抗力较弱人群更容易被其感染而出现上呼吸道感染情况。
环境与自身因素导致
环境因素影响：长期处于拥挤、通风不良的环境中，病毒和细菌更容易传播，增加上呼吸道感染的风险。比如在学校的教室、拥挤的公共交通工具里等，人员密集，空气不流通，就为病原体传播创造了条件。自身抵抗力低下：当人体自身抵抗力低下时，比如过度劳累、睡眠不足、营养不良等情况，身体抵御病毒和细菌的能力下降，就容易受到病原体侵袭而发生上呼吸道感染。像长期熬夜的人、饮食不均衡导致缺乏维生素等营养物质的人，相对更易患上呼吸道感染。