上呼吸道感染70%~80%由病毒引起，如鼻病毒、冠状病毒等，20%~30%由细菌感染导致。
病毒因素导致
常见病毒种类： 鼻病毒是引发普通感冒最常见的病毒之一，它有100多种血清型，容易在人群中传播。冠状病毒也是常见的致上呼吸道感染的病毒，像引发非典型肺炎的SARS冠状病毒、引起普通感冒的某些冠状病毒毒株等。传播途径特点： 病毒主要通过飞沫传播，比如患者打喷嚏、咳嗽产生的飞沫，健康人吸入后就可能被感染；也可以通过接触被病毒污染的物体表面，然后再接触自己的口鼻等黏膜部位而感染。
细菌因素导致
常见细菌类型： A组溶血性链球菌是较为常见的导致上呼吸道感染的细菌，它可引起急性扁桃体炎等上呼吸道感染病症。肺炎链球菌也可能引发上呼吸道感染相关的炎症。感染机制： 细菌可能是在人体抵抗力下降时，趁机侵入上呼吸道黏膜引发感染。比如当人体受凉、过度劳累后，呼吸道局部的防御功能减弱，细菌就容易滋生繁殖，导致黏膜出现炎症反应，出现咽痛、发热等上呼吸道感染的症状。
环境与机体因素导致
环境因素影响： 季节变化是一个重要的环境因素，秋冬季节气温较低，人体呼吸道黏膜血管收缩，局部抵抗力降低，更容易发生上呼吸道感染；空气污染严重时，空气中的有害颗粒、化学物质等刺激呼吸道，也会增加上呼吸道感染的风险，比如雾霾天气，空气中的污染物会损伤呼吸道黏膜，使人体易被病原体侵袭。机体自身因素： 自身免疫力低下的人群更容易患上呼吸道感染，比如老年人由于身体机能衰退，免疫力下降；儿童的免疫系统还在发育阶段，相对较弱；患有慢性疾病如糖尿病、心脏病等的患者，身体的抵抗力也比较差，这些人群在接触病原体时更易发病。另外，过度劳累、睡眠不足等也会影响机体的免疫力，增加上呼吸道感染的发生几率。