强直性脊柱炎的病因目前尚未完全明确，但已知与遗传、感染和免疫等因素密切相关。其中遗传因素较为关键，据研究，约90%的强直性脊柱炎患者携带人类白细胞抗原B27（HLA - B27），遗传因素在其发病中起到重要作用。
遗传因素方面
HLA - B27的关联： 大量的流行病学调查发现，HLA - B27阳性人群患强直性脊柱炎的概率明显高于HLA - B27阴性人群。比如在一些研究中显示，HLA - B27阳性者患强直性脊柱炎的风险比阴性者高10 - 20倍左右。如果家族中有强直性脊柱炎患者，那么其他家族成员尤其是携带HLA - B27基因的成员，患该病的几率会相对增加。
感染因素方面
肠道细菌感染的影响： 某些肠道细菌与强直性脊柱炎的发病可能存在关联。例如，肺炎克雷伯菌等肠道细菌的某些成分与人体自身组织有相似的抗原表位，当人体感染这类细菌后，免疫系统可能会错误地攻击自身组织，进而引发强直性脊柱炎的免疫反应。研究发现，强直性脊柱炎患者肠道中肺炎克雷伯菌的携带率要高于正常人群。泌尿生殖道感染的可能： 泌尿生殖道的一些感染病原体也可能参与到强直性脊柱炎的发病过程中。不过相对肠道感染来说，其具体的作用机制还在进一步研究中，但可以确定的是感染因素在强直性脊柱炎发病中是一个不容忽视的方面。
免疫因素方面
免疫系统异常激活： 强直性脊柱炎患者的免疫系统存在异常激活的情况。免疫系统中的T细胞、细胞因子等会出现紊乱。例如，肿瘤坏死因子 - α（TNF - α）等细胞因子在强直性脊柱炎患者体内明显升高，这些异常激活的免疫细胞和细胞因子会导致关节的炎症反应，进而破坏关节结构，引发强直性脊柱炎的一系列症状，如脊柱和外周关节的疼痛、僵硬等。总之，强直性脊柱炎是由遗传、感染、免疫等多种因素共同作用引起的自身免疫性疾病，了解这些病因有助于更好地认识和预防该疾病。