肩膀上起痘痘的原因和治疗方法如下：
1.痤疮：痤疮是一种常见的皮肤病，可发生在肩膀上。痤疮的发生与皮脂腺分泌过多、毛囊角化异常、痤疮丙酸杆菌感染等有关。治疗痤疮的方法包括外用药物（如维A酸乳膏、过氧化苯甲酰凝胶等）、口服药物（如抗生素、异维A酸等）、光疗等。
2.毛囊炎：毛囊炎是由细菌感染引起的毛囊炎症，也可导致肩膀上起痘痘。常见的病原菌有金黄色葡萄球菌、链球菌等。治疗毛囊炎的方法包括外用药物（如莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等）、口服药物（如头孢呋辛酯片、阿莫西林胶囊等）。
3.马拉色菌毛囊炎：马拉色菌毛囊炎是由马拉色菌感染引起的毛囊炎，常见于多汗、油脂分泌旺盛的人群。治疗马拉色菌毛囊炎的方法包括外用药物（如酮康唑乳膏、联苯苄唑乳膏等）、口服药物（如伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等）。
4.其他：肩膀上起痘痘还可能与其他因素有关，如过敏、自身免疫性疾病等。治疗方法需要根据具体病因进行选择。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案应根据个人情况而定。在治疗过程中，应避免搔抓、挤压痘痘，以免引起感染扩散。同时，应注意保持皮肤清洁，避免使用刺激性化妆品和护肤品。如果痘痘症状持续不缓解或加重，建议及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。