13岁月经长时间不干净需要明确原因，包括生理性和病理性。生理性的可通过调整改善，病理性的则要遵医嘱治疗。
一、生理性因素：
1.青春期女孩身体各器官发育不成熟，激素水平不稳定。
2.学习压力、营养失调、环境等因素会影响，导致情绪波动大，从而引起月经不规律。这种情况通常无需特殊处理，通过调整心态和生活方式，如保持良好情绪、规律作息、合理饮食等，症状可得到改善。
二、病理性因素：
1.若为多囊卵巢综合征，需进行激素六项、腹部彩超、甲状腺激素等相关检查。
2.在专业医生指导下进行激素类药物治疗，如黄体酮、屈螺酮炔雌醇片等。
需要注意的是，如果通过生理性因素的调整仍不能缓解症状，应及时就医明确病因，并在医生指导下规范治疗。
总结：13岁月经异常要明确是生理性还是病理性，生理性可调整改善，病理性需就医治疗，调整后不缓解也应及时就医。