治疗牙周炎常用的药物有抗生素类、局部用消炎类等。比如甲硝唑就常用于牙周炎的治疗，一般来说，牙周炎的药物治疗需要根据病情来选择合适的药物。
抗生素类药物
甲硝唑： 它是一种常用的抗厌氧菌药物，对引起牙周炎的厌氧菌有较好的抑制作用。不过，孕妇及哺乳期妇女要慎用，因为可能会对胎儿或婴儿产生不良影响。阿莫西林： 属于青霉素类抗生素，能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用。如果患者对青霉素类药物过敏，则不能使用阿莫西林。
局部用消炎药物
碘甘油： 可以直接涂抹在牙龈沟内，起到消炎、收敛的作用。使用时要注意避免接触到口腔黏膜的其他部位，防止引起不适。氯己定含漱液： 每天含漱几次，能够减少口腔内的细菌数量。一般含漱时间每次1分钟左右，连续使用不要超过1周，长期使用可能会导致口腔黏膜染色。
辅助类药物
维生素C： 它可以增强牙龈的抵抗力，有助于牙周组织的修复。平时可以多吃富含维生素C的水果，如橙子、柠檬等，也可以在医生指导下服用维生素C片剂。但如果本身有某些疾病，如糖尿病等，服用时需要咨询医生。复合维生素B： 对维持口腔黏膜的健康有一定帮助。它可以从日常饮食中获取，像全麦面包、瘦肉等食物中都含有一定量的复合维生素B。