肝内胆管结石的症状表现多样，部分患者可能长期无症状，而有些患者会出现腹部不适等情况。约1/3的肝内胆管结石患者可能没有明显症状，常在体检时偶然发现。而有症状的患者，常见以下几方面表现：
腹部疼痛表现
右上腹隐痛： 部分患者会出现右上腹或上腹部的隐痛，这种疼痛可能会间歇性发作，一般程度不是很剧烈，有时容易被忽视。比如有的患者会感觉右上腹隐隐作痛，持续一段时间后可能自行缓解，但过段时间又会出现。胆绞痛： 当结石引起胆管梗阻时，可能会引发胆绞痛。疼痛较为剧烈，多位于右上腹或上腹部，疼痛可向右肩部或背部放射，疼痛发作时患者往往难以忍受，可能还会伴有恶心、呕吐等症状。例如疼痛突然发作，像被拉扯一样，然后放射到肩背部，同时伴有恶心想吐的感觉。
消化道症状表现
消化不良： 患者可能会出现消化不良的情况，表现为食欲减退、腹胀等。比如吃饭时没有明显的饥饿感，吃一点东西就感觉肚子胀胀的，不想再多吃。恶心、呕吐： 由于胆管结石可能影响胆汁的正常排泄，进而影响消化功能，所以容易出现恶心、呕吐的症状。尤其是在进食油腻食物后，恶心、呕吐的症状可能会加重。比如吃了油腻的饭菜后，很快就出现恶心，接着呕吐出胃内容物。
黄疸表现
轻度黄疸： 当结石导致胆管部分梗阻时，可能会出现轻度黄疸，表现为皮肤和巩膜轻度黄染。患者可能会发现自己的眼睛白眼球部分变黄，或者皮肤看起来比平时偏黄一点。不过这种黄疸有时可能不太明显，容易被忽略。黄疸加重： 如果胆管梗阻严重，黄疸会加重，皮肤黄染会更明显，而且可能还会伴有尿色加深，像浓茶色一样，粪便颜色变浅，呈陶土色等表现。