结肠炎的治疗药物需根据病情类型等因素选择，常用的氨基水杨酸制剂中，柳氮磺吡啶是较为常用的，一般使用数周可见效。
氨基水杨酸制剂类
美沙拉嗪：分为口服制剂和灌肠剂等。口服美沙拉嗪可作用于肠道炎症部位，抑制炎症介质的产生；灌肠剂则直接作用于直肠和乙状结肠部位的炎症，能有效缓解局部的炎症反应，一般需要持续使用一段时间来控制病情。
糖皮质激素
泼尼松：对于中重度结肠炎患者，在氨基水杨酸制剂疗效不佳时可使用。它能迅速减轻炎症反应，但长期使用可能会有一些副作用，如骨质疏松、感染风险增加等，所以需要在医生严密监测下使用，且一般不宜长期大剂量应用。氢化可的松：对于急性发作且病情较重的结肠炎患者，可能会通过静脉给药的方式使用氢化可的松来快速抗炎，但同样要注意其可能带来的不良反应，如血糖升高、消化道溃疡等问题。
免疫抑制剂
硫唑嘌呤：适用于对糖皮质激素治疗效果不佳或有依赖的患者，它可以通过抑制免疫系统的异常反应来控制结肠炎的病情，但起效相对较慢，一般需要数月才能看到明显效果，而且使用过程中要密切监测血常规等指标，因为可能会引起白细胞减少等不良反应。巯嘌呤：作用机制与硫唑嘌呤类似，也是用于免疫抑制来治疗结肠炎，在使用时同样需要关注药物的副作用，如肝损害等情况，并且要定期进行相关指标的检测。
生物制剂
英夫利昔单抗：对于一些重度且对传统治疗药物无效的结肠炎患者可考虑使用。它是一种靶向生物制剂，能特异性地结合肿瘤坏死因子 - α等炎症因子，从而发挥抗炎作用，但使用前需要进行严格的评估，并且使用过程中要注意感染等风险，因为这类药物可能会降低机体的抵抗力，增加感染的发生几率。