最里面牙齿旁边的肉肿了可采取如下方法处理：口服药物、手术切除、拔牙。以下是具体内容：
一、口服药物。牙齿旁边的肉肿大多是因细菌感染致牙龈炎症病变。可在医生指导下口服消炎药物治疗，如选择头孢或阿莫西林类消炎药物，能减轻局部炎症反应，防止肿胀加重。
1.头孢类药物：具有广谱抗菌作用，可有效抑制细菌生长繁殖。
2.阿莫西林类药物：能较好地对抗多种细菌感染。
二、手术切除。症状严重者可通过手术切除来处理，需将局部脓包完整切除，从而改善症状，避免组织肿胀加重。
三、拔牙。若肉肿是智齿冠周炎反复发作引起，在炎症控制好后，可通过拔牙处理，这样可避免智齿反复发炎以及牙龈肿胀出现。
总之，当出现最里面牙齿旁边肉肿的情况时，可根据具体情况选择合适的方法来处理，以改善症状和恢复健康。