治疗口腔溃疡可以使用局部用药，比如西瓜霜喷剂，一般喷后几分钟就能起到一定的止痛、促进愈合作用。
局部用药类
含片类： 如西地碘含片，它可以在唾液作用下逐渐释放出碘，有杀菌抗感染的作用，能帮助口腔溃疡创面的恢复。一般一次含服1片，一天3 - 5次。但对碘过敏者禁用。散剂类： 冰硼散也是常用的治疗口腔溃疡的散剂，具有清热解毒、消肿止痛的功效。使用时取少量药粉涂于患处，不过孕妇慎用。
促进愈合类
重组人表皮生长因子凝胶： 能促进皮肤与黏膜创面的愈合。它可以刺激上皮细胞的增殖、迁移，加快口腔溃疡创面的修复。每天使用1 - 2次，将凝胶涂于患处即可。但对凝胶过敏者禁用。康复新液： 具有通利血脉、养阴生肌的作用。既可内服也可外用，外用时用医用纱布浸透药液后敷于患处，约4 - 6小时更换一次，能促进口腔溃疡创面的愈合，儿童可以使用，但对本品过敏者禁用。
止痛类
利多卡因凝胶： 属于局部麻醉药，能起到止痛的作用。如果口腔溃疡疼痛剧烈，可在进食前短时间使用，涂于患处，能快速缓解疼痛，但连续使用不宜超过3天，孕妇和哺乳期妇女慎用。苯佐卡因凝胶： 同样是局部止痛药物，能暂时缓解口腔溃疡引起的疼痛。使用时涂于患处，儿童要在成人监护下使用，对苯佐卡因过敏者禁用。