新型冠状病毒肺炎主要是由新型冠状病毒引起的。该病毒属于β属的冠状病毒，有研究显示其基因特征与SARSr-CoV和MERSr-CoV有明显区别。
病毒的来源方面
野生动物携带： 目前认为新型冠状病毒可能来源于野生动物，比如在一些野生动物体内发现了与该病毒基因序列高度相似的病毒。例如，在蝙蝠体内就检测到了相关的冠状病毒，推测可能是病毒的自然宿主。人际传播： 该病毒具有人传人的能力，主要通过飞沫传播和接触传播。当感染者咳嗽、打喷嚏时，会产生含有病毒的飞沫，其他人吸入这些飞沫就可能被感染；另外，接触被病毒污染的物品后，再触摸自己的口、鼻、眼等黏膜部位，也有可能感染。
人群易感性方面
普遍易感： 人群对新型冠状病毒普遍易感。不同年龄、性别、职业的人都有可能被感染。一般来说，老年人以及有基础疾病的人群感染后，发展为重症的风险相对较高。比如患有糖尿病、高血压、心脏病等基础疾病的人群，感染新型冠状病毒后，病情恶化的可能性比健康人群更大。免疫力差异影响： 免疫力较低的人更容易被感染，像一些长期使用免疫抑制剂的患者，由于自身免疫系统功能受到抑制，对病毒的抵御能力减弱，感染风险增加。而免疫力正常的人群，如果接触了大量病毒，也可能被感染。
环境因素影响方面
密闭不通风环境： 在密闭、不通风的环境中，病毒更容易聚集传播。例如在电梯、商场的封闭空间内，如果有感染者，病毒在空气中停留的时间较长，其他人感染的几率就会增大。卫生条件差的场所： 卫生条件较差的场所，病毒传播的风险也较高。比如一些拥挤、卫生设施不完善的公共场所，人员密集且卫生难以保障，病毒很容易通过各种途径传播开来。