大便有出血且肛门疼时，应前往结直肠肛门外科或肛肠外科检查，以明确病因并根据不同疾病采取不同处理方式，常见疾病如下：
一、痔疮：
1.若痔疮出血伴肛门疼痛，可使用痔疮膏和痔疮栓进行治疗，比如马应龙痔疮膏、复方角菜酸酯乳膏、复方角菜酸酯栓等。
2.痔疮出血还可口服地奥司明、迈之灵来减轻静脉曲张、水肿，进而降低出血情况。
二、肛裂：若是陈旧性肛裂，则可能需要手术治疗。
三、肛门肌肉问题：
1.若肛门肌肉有痉挛或失弛缓的状况，可能需要在肛门周围进行肉毒素注射、开展肛门解痉治疗。
四、肿瘤：
1.直肠和肛门肿瘤，如直肠下端的直肠癌或肛管癌等，可能需要手术治疗。
2.倘若肿瘤处于晚期无法手术，可能需进行放疗或化疗等。
五、脓肿：直肠壁内脓肿、肛门周围脓肿引发的破溃、出血，此时可能也需要进行手术、引流等治疗。
总结概况提示：当出现大便出血伴肛门疼痛症状时，要及时就医检查，明确具体病因，根据不同疾病类型选择合适的治疗方法，如痔疮可用药或手术，肛裂、肿瘤、脓肿等也有相应的治疗手段。