肾结石的形成与多种因素相关，比如人体尿液中一些物质浓度过高，就容易析出形成结石。一般来说，肾结石的病因主要有以下几类：
代谢异常方面
尿液成分改变： 当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质含量过高时，就容易形成结石。例如，尿钙排泄增多会增加肾结石形成风险，正常成人24小时尿钙排泄量一般在200 - 300毫克，如果超过这个范围，就可能更易长结石。尿酸代谢异常： 体内尿酸生成过多或排泄减少，会使尿酸浓度升高，尿酸盐结晶容易在肾脏沉积形成结石。正常血尿酸水平，男性一般在150 - 416微摩尔/升，女性在89 - 357微摩尔/升，超过这个范围尿酸盐结石风险增加。
局部因素影响
尿路梗阻： 当尿路存在狭窄、肿瘤等情况时，尿液排出受阻，尿液中的晶体物质就容易在局部沉积，进而形成结石。比如肾盂输尿管连接部狭窄的患者，尿液引流不畅，肾结石发生率就会高于正常人。尿路感染： 一些细菌、感染产物等可以作为核心，促使结石形成。像变形杆菌等细菌能分解尿素产生氨，使尿液碱化，促使磷酸镁铵及磷酸钙沉积形成结石。
饮食与生活习惯因素
饮食结构不合理： 长期高钙、高草酸、高嘌呤饮食容易引发肾结石。高草酸饮食比如长期大量吃菠菜、苋菜、巧克力等，会使尿草酸排泄增加。高嘌呤饮食如经常吃动物内脏、海鲜等，会使尿酸生成增多。饮水不足： 每天饮水量少于1500毫升，尿液就会浓缩，导致尿液中晶体物质浓度升高，容易析出形成结石。正常情况下，建议每天饮水量保持在2000 - 3000毫升以上，以保证足够的尿量稀释尿液中的成石物质。缺乏运动： 长期缺乏运动，会导致尿液中的晶体物质更容易在肾脏等部位沉积，增加肾结石形成的可能性。