肾结石的病因较为复杂，主要与以下几方面因素有关。首段：肾结石的形成受多种因素影响，其中尿液中某些物质浓度过高是重要原因之一，比如尿液中钙、草酸、尿酸等成分浓度异常升高时，就容易形成肾结石，有数据显示，高钙尿症是导致肾结石的常见因素之一。
代谢异常相关
尿液成分异常：当尿液中钙、草酸、尿酸、胱氨酸等物质排出量增加时，就容易形成结石。例如，高钙尿症患者尿液中钙的含量高于正常水平，长期如此就可能促使肾结石形成；还有草酸钙结石，就是因为尿液中草酸浓度过高，与钙结合后形成结晶，逐渐沉积成石。尿pH值改变：尿液酸碱度的变化也会影响肾结石的形成。比如，尿酸结石多在酸性尿液中形成，而磷酸镁铵结石则易在碱性尿液中形成。
局部因素相关
尿路梗阻：如果存在尿路狭窄、前列腺增生等情况，会导致尿液排出受阻，尿液中的晶体物质就容易在局部沉积，进而形成结石。比如，输尿管狭窄的患者，尿液在输尿管内流动不畅，就为肾结石的形成创造了条件。感染因素：泌尿系统感染时，细菌、坏死组织等可作为核心，促使晶体物质围绕其沉积形成结石。像变形杆菌感染时，细菌产生的尿素酶可分解尿液中的尿素，使尿液碱化，有利于磷酸镁铵等结石的形成。
其他因素相关
饮食因素：长期摄入高嘌呤食物，如动物内脏、海鲜等，会使尿酸生成增加，容易引发尿酸结石；长期摄入高草酸食物，如菠菜、浓茶等，会导致尿液中草酸含量升高，增加草酸钙结石形成的风险。此外，饮水过少会使尿液浓缩，导致尿液中晶体物质浓度升高，也容易形成肾结石，一般建议肾结石患者每天饮水量应达到2000 - 3000毫升以上，以稀释尿液，减少结石形成风险。药物因素：某些药物也可能增加肾结石的形成风险。比如，长期服用维生素C，在体内代谢后可能会使草酸排出增加；长期服用氨苯蝶啶等药物，也可能诱发肾结石。