地中海贫血主要是由于遗传因素导致的。正常情况下，人体的珠蛋白基因决定了血红蛋白的合成，而地中海贫血患者是因为珠蛋白基因发生了突变或缺失，使得珠蛋白链合成障碍，从而引发贫血等一系列症状。据统计，地中海贫血是一种较常见的单基因遗传病。
遗传基因的缺陷类型
α地中海贫血： 是由于α珠蛋白基因的缺失或突变引起。如果是α珠蛋白基因部分缺失，就可能导致α珠蛋白链合成减少，进而影响血红蛋白的正常构成。例如，东南亚地区α地中海贫血的发生率相对较高，与当地人群的基因变异情况有关。β地中海贫血： 主要是β珠蛋白基因的突变所致。不同的β珠蛋白基因突变会导致β珠蛋白链合成不同程度的减少或异常。像地中海沿岸国家以及我国南方地区，β地中海贫血的携带率相对较高。
遗传方式特点
常染色体隐性遗传： 父母双方如果都是地中海贫血基因携带者，他们的子女就有一定的概率遗传到致病基因而发病。比如父母双方都是轻型地中海贫血患者（携带一个致病基因），那么他们的子女有25%的概率是重型地中海贫血患儿，50%的概率是轻型携带者，25%的概率是正常的。不同类型遗传差异： α地中海贫血根据缺失基因的数量不同，临床表现有所差异。如果是缺失3个α珠蛋白基因，可能表现为轻型α地中海贫血；而缺失4个α珠蛋白基因，就会导致胎儿水肿综合征，胎儿大多在孕期或新生儿早期死亡。β地中海贫血根据病情轻重可分为轻型、中型和重型，重型β地中海贫血患儿出生后不久就会出现严重贫血、黄疸、肝脾肿大等症状，需要长期输血等治疗来维持生命。
人群易感性因素
地域分布倾向： 地中海贫血在全球的分布有一定的地域特点，高发地区包括地中海沿岸国家、中东地区、东南亚地区等。这与这些地区的人群长期的基因进化和遗传背景有关。比如意大利、希腊等地中海沿岸国家，地中海贫血的发病率相对较高。种族遗传背景： 一些特定种族人群由于长期的基因遗传，更容易携带地中海贫血相关的致病基因。例如，我国南方的壮族、苗族等少数民族中，地中海贫血的携带率相对高于北方地区的汉族人群。这是因为不同种族在历史发展过程中，适应环境等因素导致基因频率发生了变化，使得地中海贫血在这些种族人群中更容易出现。