食管反流病主要是多种因素导致下食管括约肌功能障碍等引起的。一般来说，食管下括约肌压力降低是重要原因之一，比如正常人食管下括约肌能阻止胃内容物反流，但某些情况会使它压力下降，就容易引发反流。
食管下括约肌功能异常相关
下食管括约肌结构异常： 像食管裂孔疝时，部分胃组织通过食管裂孔进入胸腔，会影响下食管括约肌的正常结构和功能，使得抗反流屏障被破坏，从而增加食管反流病发生风险。下食管括约肌压力降低： 一些激素变化等情况可能导致下食管括约肌压力降低，比如妊娠期间，体内激素改变可能使下食管括约肌压力下降，进而容易出现食管反流。
食管清除作用降低相关
食管蠕动异常： 正常情况下食管蠕动可以帮助清除反流物，当食管蠕动出现异常时，比如某些神经系统疾病影响食管蠕动功能，就会导致反流物清除减慢，长时间反流物刺激食管黏膜，容易引发食管反流病。唾液分泌减少： 唾液能中和胃酸、清除反流物，如果唾液分泌减少，比如老年人唾液分泌功能减退，或者服用某些药物导致唾液分泌减少，就会使食管清除反流物的能力下降，增加食管反流病发生几率。
胃排空延迟相关
胃排空障碍： 胃排空延迟会使胃内食物潴留，胃内压力升高，当胃内压力超过下食管括约肌压力时，就容易导致胃内容物反流至食管。比如糖尿病患者可能会出现胃轻瘫，引起胃排空延迟，进而增加食管反流病的发病可能。饮食习惯影响： 进食过多、过快，或者吃了一些高脂肪、巧克力、咖啡等食物，也可能影响胃排空，导致胃内压力升高，促使反流发生，长期这样就容易引发食管反流病。