一觉起来发现喉咙疼痛，这可能由以下原因导致：
一、急性咽喉炎
1.病因：主要由病毒或细菌感染引起，也可继发于急性鼻炎、急性鼻窦炎、急性扁桃体炎等疾病。环境因素如气候干燥时摄水不足、粉尘、过敏原等，以及用声过度、咽喉部有异物等也可引发。
2.症状：以咽喉疼痛、声音嘶哑、咳嗽、咳痰等为主。全身症状轻重程度不一，严重时可出现发热畏寒、食欲减退、四肢酸痛等。
二、流行性感冒
1.病因：主要是流感病毒引起的急性呼吸道疾病。
2.症状：症状有发热、寒战、头痛、全身肌肉关节酸痛等中毒症状，同时伴有流涕鼻塞、咽喉疼痛、干咳、结膜充血等。
三、反流性食管炎
1.病因：患者夜间平卧睡眠时，胃酸反流至咽喉部。
2.症状：致使次日晨起出现咽喉部疼痛，还伴有烧心、胸痛、上腹痛、上腹灼烧感、嗳气等症状。
总结概况提示：喉咙疼痛可能是多种疾病引起的，当出现这种情况时要注意区分具体病因，以便采取针对性的治疗措施。