肝上血管瘤的成因目前尚不十分明确，可能与多种因素有关。一般认为，先天性发育异常是重要因素之一，在胚胎发育过程中，血管发育出现异常，导致血管内皮细胞异常增殖，从而形成血管瘤。另外，女性体内的雌激素水平变化也可能对肝血管瘤的发生有一定影响，研究发现女性患者相对较多，可能与雌激素相关。还有观点认为，肝内毛细血管感染后变形，导致毛细血管扩张，也可能引发肝血管瘤。
先天性发育异常方面
胚胎时期血管发育偏差： 在胚胎发育的早期阶段，血管系统的形成出现了一些偏差情况。例如，在原始血管网形成时，某些区域的血管组织没有按照正常的模式进行分化和发育，使得局部的血管内皮细胞出现异常的聚集和增殖。这种异常的增殖逐渐形成了团块状的结构，也就是肝上的血管瘤。遗传因素的潜在影响： 虽然目前还没有确凿的证据表明肝血管瘤具有明显的遗传性，但是有研究发现，在某些家族中，肝血管瘤的发病几率可能会相对高一些。这提示遗传因素可能在先天性发育异常导致肝血管瘤的过程中起到了一定的潜在作用，不过具体的遗传机制还需要进一步深入研究来明确。
雌激素水平影响
女性激素与血管瘤关系： 大量临床观察发现，女性肝血管瘤患者的数量相对多于男性。这可能与女性体内的雌激素水平有关。雌激素能够影响血管内皮细胞的生长和代谢等过程。当女性体内雌激素水平出现波动变化时，可能会刺激肝内的血管内皮细胞发生异常增殖，进而促使肝血管瘤的形成。特定生理阶段的变化： 在女性的青春期、孕期等特定生理阶段，体内的雌激素水平会发生较为明显的变化。比如在孕期，女性体内的雌激素水平会大幅升高，这时候就有可能增加肝血管瘤发生或者生长的风险。有统计数据显示，孕期女性肝血管瘤的发生率可能会比平时有所上升，但具体的上升幅度还需要更多大规模的研究来精准确定。
血管感染因素
肝内毛细血管感染过程： 当肝脏内的毛细血管受到感染时，可能会引发一系列的病理变化。细菌等病原体感染毛细血管后，会导致毛细血管的内皮细胞出现炎症反应，进而影响到毛细血管的正常结构和功能。在炎症的刺激下，毛细血管可能会发生变形，并且出现扩张的情况。随着时间的推移，这种异常的变化持续发展，就有可能逐渐形成肝血管瘤。感染后的修复与异常增殖： 在毛细血管感染后的修复过程中，可能会出现异常的情况。正常的修复机制被打破，血管内皮细胞不再按照正常的调控进行增殖，而是出现了无序的、过度的增殖现象。这种异常增殖使得局部的血管组织不断堆积，最终形成了肝血管瘤的病变结构。