睡醒后眼睛肿了可通过以下方式治疗：
一、药物治疗：
1.若为病毒感染引起，可遵医嘱使用更昔洛韦滴眼液、伐昔洛韦滴眼液等药物进行治疗；若为细菌感染引起，可使用左氧氟沙星滴眼液等，还可在医生指导下口服阿莫西林、阿奇霉素等抗生素以有效治疗。
二、冷敷治疗：
患者睡醒后眼睛肿了，可采用冷敷的方式，这能抑制局部神经，促使肿胀快速消退，同时缓解眼睛疼痛症状。
三、手术治疗：
若眼睛肿是由麦粒肿引起，且经上述方法治疗效果不佳时，可考虑手术治疗。
此外，患者在治疗期间还应注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物，以防病情持续加重。
总结：睡醒后眼睛肿了可根据具体情况选择药物、冷敷或手术等方式治疗，同时要注意相关饮食禁忌。