可通过血人绒毛膜促性腺激素（hCG）水平变化及超声表现来判断。生化妊娠时hCG值较低，一般小于2000IU/L，超声检查看不到孕囊；自然流产时hCG有变化且超声可发现孕囊等异常情况。
生化妊娠特点
血hCG能测出怀孕，但数值很低，之后很快下降，超声检查子宫内看不到孕囊，一般无明显腹痛等特殊表现，多发生在孕5周内，可能与受精卵质量不佳等因素有关，女性身体一般能较快恢复。
自然流产表现
血hCG先升高后下降，超声检查能发现宫腔内曾有孕囊等结构，可能伴有阴道流血、腹痛等症状，流产原因较多，如胚胎染色体异常、母体内分泌异常等，不同情况处理及对身体影响不同，若多次自然流产需进一步检查病因。对于有生育计划的夫妻，若发生生化妊娠或自然流产，要注意休息，保持良好心态，生化妊娠后一般次月可再备孕，自然流产后需根据具体情况遵医嘱适当调养后再考虑备孕，同时要关注自身身体变化，如有异常及时就医。