耳朵两侧骨头疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的情况：
1.颞下颌关节紊乱综合征：这是一种累及颞下颌关节和咀嚼肌群的疾病，可能导致耳朵两侧骨头疼痛、咀嚼时疼痛加剧、张口受限等症状。病因尚不明确，可能与精神因素、咬合因素、免疫因素等有关。治疗方法包括一般治疗、药物治疗、物理治疗、咬合板治疗、注射治疗和手术治疗等。
2.耳部感染：如中耳炎、外耳道炎等，炎症可能导致耳部疼痛，并放射至耳朵两侧骨头。还可能伴有耳部流脓、听力下降、耳鸣等症状。治疗方法根据感染的类型和严重程度而定，可能包括使用抗生素、滴耳液等药物治疗，或进行手术引流。
3.外伤：耳部受到外力撞击、挤压或拉伤等，可能导致骨头损伤或软组织炎症，引起疼痛。疼痛通常在受伤后立即出现，可能伴有肿胀、淤血等症状。治疗方法包括休息、冷敷、止痛药物等，严重的情况可能需要进一步的检查和治疗。
4.颈椎病：颈椎病变可能压迫神经根，导致颈部、肩部和耳朵两侧骨头疼痛。疼痛可能放射至上肢，还可能伴有上肢麻木、无力等症状。治疗方法包括物理治疗、药物治疗、牵引治疗、手术治疗等，具体治疗方案应根据病情而定。
5.其他原因：如神经痛、肌肉劳损、肿瘤等也可能引起耳朵两侧骨头疼。
如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，如发热、听力下降、面部麻木等，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以确定病因并采取相应的治疗措施。在就医之前，可以尝试以下方法缓解疼痛：
休息：避免过度使用耳部，减少耳部的活动。
冷敷或热敷：用冰袋或热毛巾敷在疼痛部位，每次15-20分钟，每天数次。
避免刺激：避免食用辛辣、刺激性食物，避免长时间佩戴耳机等。
药物治疗：可以口服非甾体抗炎药（如布洛芬）缓解疼痛，但应按照医生的建议使用。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，因此治疗方法应根据具体情况而定。在治疗过程中，应遵循医生的建议，注意休息和保持良好的生活习惯。如果疼痛加重或出现其他异常症状，应及时复诊。