胃食管反流通常是多种因素共同作用导致的。比如下食管括约肌功能障碍是常见原因之一，正常情况下下食管括约肌能阻止胃内容物反流，但当它压力降低时，就容易引发反流。另外，食管清除作用降低也会增加胃食管反流的风险，正常食管通过蠕动等方式能及时清除反流物，若清除能力下降，反流物就会在食管内停留更久，刺激食管黏膜。还有胃酸分泌过多，当胃酸分泌超出正常范围，对食管黏膜的刺激增强，也容易引发胃食管反流。
下食管括约肌相关因素
下食管括约肌压力降低： 一些因素会使下食管括约肌压力下降，比如妊娠期间，由于激素变化等原因，下食管括约肌压力可降低，从而增加胃食管反流的发生几率。还有肥胖人群，过多的脂肪堆积可能影响下食管括约肌的功能，导致其压力降低。下食管括约肌结构异常： 像食管裂孔疝患者，食管裂孔扩大，部分胃组织通过裂孔进入胸腔，会改变下食管括约肌的正常结构和功能，使得胃食管反流更容易发生。
食管清除作用方面
食管蠕动减弱： 老年人食管蠕动功能可能会减弱，这就导致食管清除反流物的能力下降。例如，50岁以上的老年人相对年轻人更易出现食管蠕动减弱的情况，进而增加胃食管反流风险。唾液分泌减少： 唾液可以帮助中和胃酸、清除反流物，如果唾液分泌减少，比如一些药物副作用可能导致唾液分泌减少，就会影响食管对反流物的清除，容易引发胃食管反流。
胃酸分泌相关因素
胃酸分泌过多： 某些疾病状态下胃酸分泌会增多，比如患有十二指肠溃疡的患者，往往存在胃酸分泌亢进的情况，过多的胃酸容易反流至食管，刺激食管黏膜，引发胃食管反流症状。还有长期精神紧张、焦虑的人，可能会通过神经内分泌调节导致胃酸分泌增加，增加胃食管反流的发生风险。