子宫内膜异位症的引起原因目前尚未完全明确，一般认为可能与以下因素有关。首先是经血逆流，正常情况下，月经血从子宫腔经宫颈、阴道流出体外，但有少部分经血可能会通过输卵管逆流进入盆腔，其中的子宫内膜细胞就可能在盆腔内种植、生长，这是较为被认可的一个重要原因，据统计，约有10% - 15%的女性存在经血逆流现象，但并不是所有人都会患上子宫内膜异位症。
遗传因素：
家族遗传倾向： 如果家族中有直系亲属患有子宫内膜异位症，那么自身患病的风险会有所增加。研究发现，子宫内膜异位症具有一定的遗传易感性，可能与某些基因的突变或遗传标记有关。例如，有姐妹、母亲患有该病的女性，其发病几率比没有家族史的女性要高一些。
免疫调节异常：
免疫系统功能紊乱： 人体的免疫系统在正常情况下可以识别和清除异位的子宫内膜细胞，但当免疫系统出现异常时，就可能无法有效地清除这些异位的细胞，从而导致子宫内膜异位症的发生。比如，体内的免疫细胞不能正常发挥作用，不能及时将盆腔内异位种植的子宫内膜细胞清除掉，使得这些细胞在局部不断生长、繁殖，形成异位病灶。
炎症反应：
盆腔炎症影响： 盆腔部位的炎症可能会促进子宫内膜异位症的发生。长期的盆腔炎症会改变盆腔内的微环境，使得子宫内膜细胞更容易种植和生长。例如，盆腔炎性疾病可能会导致盆腔组织的粘连、充血等，为子宫内膜细胞的异位种植创造了有利条件。而且，炎症反应还会释放一些细胞因子等物质，进一步影响子宫内膜细胞的行为，促使其在异位部位存活和增殖。