口腔溃疡的治疗药物有多种，一般局部用药较为常用，比如西瓜霜喷剂，通常使用后1~2天能起到一定缓解疼痛、促进愈合的作用。
局部外用药物
含漱剂： 氯己定含漱液是常见的含漱剂，它能杀灭口腔内的细菌，抑制炎症。使用时取10毫升左右含漱，每天2~3次，可帮助清洁口腔，减轻口腔溃疡部位的炎症。散剂： 冰硼散也是常用散剂，把它撒在口腔溃疡表面，能起到清热解毒、消肿止痛的作用，一般用药后几分钟就能感觉疼痛有所减轻。
促进愈合的药物
重组人表皮生长因子凝胶： 它可以促进口腔黏膜细胞的增殖、迁移，加快溃疡面的愈合。每天涂抹2~3次在溃疡处，一般连续使用3~5天能看到溃疡明显好转。不过儿童使用时要在成人监护下进行。维生素类药物： 维生素B₂可以口服，它能参与机体的代谢，缺乏维生素B₂时容易引发口腔溃疡，每天服用3次，每次1~2片，能从一定程度上预防和辅助治疗口腔溃疡。
缓解疼痛的药物
利多卡因凝胶： 这是一种局部麻醉剂，对于疼痛较为剧烈的口腔溃疡，在进食前涂抹少许在溃疡处，能起到暂时止痛的作用，让患者在进食时减轻痛苦，但不能频繁使用，一般一天不超过4次。苯佐卡因凝胶： 同样是局部止痛药物，涂抹后能快速缓解口腔溃疡带来的疼痛，使用方法是在溃疡表面轻轻涂抹一层，不过孕妇和哺乳期女性要慎用。
注意事项
饮食方面： 患口腔溃疡期间要避免吃辛辣、刺激性食物，像辣椒、生姜等，这些食物会刺激溃疡面，加重疼痛。同时要多吃富含维生素的蔬菜水果，比如橙子、菠菜等，有助于溃疡愈合。特殊人群： 老年人如果患有口腔溃疡，用药时要更谨慎，最好在医生指导下选择药物，因为老年人可能同时有其他基础疾病，某些药物可能会有相互作用。儿童使用口腔类外用药物时，要防止误吞，而且2岁以下儿童一般不建议自行使用成人的口腔溃疡药物，需咨询医生后选择适合儿童的安全药物。