大三阳转小三阳的机率因个体差异而异，一般来说，成人慢性乙肝患者中每年大约有2%~15%的人会自然发生大三阳转小三阳的情况，但这不是绝对的固定数值。
影响大三阳转小三阳机率的因素一：感染阶段
急性期感染：
对于免疫功能正常的成人急性乙肝感染者，大约有90%左右可以完全清除病毒，其中部分人会出现大三阳转小三阳的情况，但具体比例不太容易精准界定，不过相对而言，急性期时大三阳转小三阳的机率相对有一定可能性，但不是一个固定的很高的比例数值。
慢性期感染：
在慢性乙肝感染者中，大三阳转小三阳的机率相对较低且因人而异。如果是年轻、免疫状态较好的慢性乙肝患者，经过长期观察，部分人可能会随着自身免疫功能的适度激活等情况，有一定机率实现大三阳向小三阳的转变，但整体每年的发生率维持在较低水平，通常是2% - 15%左右的波动范围。
影响大三阳转小三阳机率的因素二：治疗干预情况
未接受治疗：
如果慢性乙肝患者没有接受任何抗病毒等治疗措施，那么其自然发生大三阳转小三阳的机率相对较低，而且进展速度比较缓慢，可能需要数年甚至更长时间才会有少数人出现转变。
接受抗病毒治疗：
当慢性乙肝患者接受正规的抗病毒治疗时，比如使用恩替卡韦、替诺福韦等核苷（酸）类似物进行抗病毒治疗，在规范治疗的过程中，部分患者也有可能出现大三阳转小三阳的情况，但这也不是所有患者都会发生，而且发生的时间等也有差异，一般来说规范抗病毒治疗有助于提高实现大三阳转小三阳的机率，但具体能提高到多少因个体对药物的反应等不同而不同。
影响大三阳转小三阳机率的因素三：自身免疫状况
免疫功能较强者：
自身免疫功能比较强的乙肝感染者，身体的免疫系统能够较好地识别和应对乙肝病毒，相对来说更有可能在合适的时机实现免疫系统对乙肝病毒的有效控制，从而有一定机率促使大三阳逐渐转变为小三阳，不过具体机率还是难以精确量化，但相比免疫功能低下者机率会相对高一些。
免疫功能低下者：
如果自身免疫功能低下，比如患有艾滋病等基础疾病的乙肝合并感染者，或者长期使用免疫抑制剂的人群，其身体对乙肝病毒的清除能力较弱，大三阳转小三阳的机率就会明显降低，因为免疫系统无法很好地发挥作用来清除乙肝病毒实现病情的这种转变。