生殖器疱疹的确诊需综合多方面，包括患者病史、临床症状、实验室检查结果以及鉴别诊断：
一、病史：若存在不洁性行为，或有多个新伴侣，亦或性伴侣有感染史等情况。
二、临床症状：当生殖器及肛门处出现簇集分布或散在的小水疱或溃疡，同时伴有发热、乏力、疼痛等表现时，可初步推测为生殖器疱疹。
三、实验室检查结果：
1.病毒分离培养是诊断生殖器疱疹的金标准。
2.还可借助抗原检测、核酸检测和血清学检查等结果，再结合病史与临床症状进行全面分析以诊断生殖器疱疹。
四、鉴别诊断：生殖器疱疹需与梅毒硬下疳、软下疳、固定性药疹和白塞病等加以鉴别。
总之，生殖器疱疹的确诊需要综合考虑上述各个方面，通过详细了解病史、仔细观察临床症状、进行准确的实验室检查以及做好鉴别诊断，才能更为准确地做出诊断。