肾结石形成的原因有多种，其中代谢异常是常见因素之一。例如，尿液中钙、草酸、尿酸等物质排出量增加，就容易形成肾结石。像尿液中钙浓度过高，超过了尿液的溶解能力，钙就会结晶析出，进而形成结石。
饮食因素相关
高草酸食物摄入过多： 如果长期大量吃富含草酸的食物，比如菠菜，每100克菠菜中草酸含量较高，长期大量食用，会使体内草酸含量升高，尿液中草酸排泄增多，增加肾结石形成风险。还有坚果等食物，也含有一定量草酸，过量食用也不利于健康。高嘌呤食物摄入过多： 像动物内脏，动物内脏中嘌呤含量较高，过多食用会使尿酸生成增加。尿酸排出增多时，若尿液中尿酸浓度过高，就容易形成尿酸结石。海鲜也是高嘌呤食物，长期大量吃海鲜，也会增加肾结石发生几率。
疾病因素影响
泌尿系统梗阻： 当泌尿系统存在梗阻情况时，尿液排出不畅，尿液中的晶体物质就容易在局部沉积，逐渐形成结石。比如患有前列腺增生的患者，前列腺增生会导致尿道梗阻，尿液排出受阻，尿液中的成分就容易沉淀形成结石。还有输尿管狭窄的人，尿液通过受阻，也容易引发肾结石。某些代谢性疾病： 像甲状旁腺功能亢进症，患者体内甲状旁腺激素分泌过多，会使血钙升高，进而导致尿钙增多，容易形成钙性肾结石。还有肾小管酸中毒患者，尿液的酸碱平衡等代谢功能出现异常，也会增加肾结石形成的可能性。