地图舌的病因目前还不完全明确，可能与多种因素有关。一般认为，遗传因素可能起到一定作用，有研究显示约10% - 30%的地图舌患者有家族史。
一、营养因素相关
维生素缺乏： 缺乏B族维生素可能与地图舌有关，比如维生素B2缺乏时，可能影响黏膜的正常代谢，从而增加地图舌发生的风险。微量元素缺乏： 锌等微量元素缺乏也可能参与地图舌的形成。有研究发现，地图舌患者血清中锌的水平可能低于正常人群，锌对于维持黏膜的正常结构和功能有重要作用，缺乏时可能导致黏膜病变。
二、免疫因素相关
免疫功能异常： 部分地图舌患者存在免疫功能的改变。例如，机体的细胞免疫和体液免疫可能出现一定程度的失调，使得口腔黏膜的防御功能受到影响，容易出现地图舌的表现。比如一些自身免疫性疾病患者中，地图舌的发生率可能相对较高。
三、口腔局部因素相关
口腔卫生状况： 口腔卫生不良时，口腔内的细菌、真菌等微生物容易滋生，可能刺激口腔黏膜，引发地图舌。比如不按时刷牙、不漱口，导致食物残渣残留，破坏口腔内环境的稳定。牙齿萌出因素： 在儿童换牙期，牙齿萌出过程中可能对舌黏膜产生刺激，从而诱发地图舌。例如，乳牙脱落、恒牙萌出时，局部的刺激可能影响舌黏膜的正常状态，导致地图舌的出现。