甲状腺炎的发病原因较为多样，比如自身免疫因素就可能引发，像自身免疫性甲状腺炎，约有10% - 15%的人群可能存在遗传易感性相关的自身免疫异常情况。
自身免疫因素导致
自身免疫性甲状腺炎： 当人体自身免疫系统出现紊乱时，免疫系统会错误地攻击甲状腺组织。例如，在某些遗传背景下，自身抗体如甲状腺过氧化物酶抗体（TPOAb）、甲状腺球蛋白抗体（TgAb）等会异常升高，持续攻击甲状腺细胞，从而引发甲状腺炎。这种情况在女性中的发病率相对较高，尤其是30 - 50岁的女性更为常见。病毒性甲状腺炎： 病毒感染也是导致甲状腺炎的一个重要因素。比如柯萨奇病毒、腮腺炎病毒、流感病毒等感染人体后，可能会引起甲状腺的炎症反应。当病毒侵入甲状腺组织，会激发机体的免疫反应，导致甲状腺细胞受损，引发炎症。一般在病毒感染后的1 - 3周左右，可能会出现甲状腺炎的相关症状。
感染因素引发
细菌感染： 某些细菌感染也可能波及甲状腺，引发甲状腺炎。例如，金黄色葡萄球菌、链球菌等细菌感染，可能通过血液传播或直接蔓延至甲状腺部位，引起甲状腺的炎症性改变。不过相对来说，细菌感染导致甲状腺炎的情况不如病毒感染常见，但一旦发生，也会引起甲状腺局部的红肿、疼痛等炎症表现。真菌感染： 虽然真菌感染引发甲状腺炎较为少见，但也有个别案例报道。一些特殊的真菌病原体感染甲状腺组织后，会导致甲状腺出现炎症反应。不过这类情况往往是在机体免疫力极度低下的人群中更容易发生，比如长期使用免疫抑制剂的患者等。
放射性损伤相关
放射性治疗后： 当颈部接受过放射性治疗，比如因头部或颈部恶性肿瘤进行过放射性碘治疗或外照射治疗等，射线会对甲状腺组织造成损伤，从而引发甲状腺炎。一般在放射性治疗后的数月至数年不等，可能会逐渐出现甲状腺功能异常以及甲状腺炎症相关的表现。例如，接受放射性碘治疗甲亢后，部分患者可能会在数周或数月后出现放射性甲状腺炎，表现为甲状腺疼痛、肿胀等症状。