男性感染支原体或衣原体后，症状表现多样。一般来说，支原体感染男性可能出现尿道刺痛、瘙痒等症状，约有50%的患者会有尿道分泌物，量少，呈稀薄浆液性。而衣原体感染男性常见症状是尿道不适、发痒、烧灼感或刺疼，尿道红肿，分泌物多为浆液状、稀薄，晨起有“糊口”现象。
泌尿生殖系统症状表现
尿道不适表现：男性感染后，早期可能感觉尿道内轻微不适，像有细微的刺痛感，这种不适会时轻时重。分泌物情况：部分患者会出现尿道分泌物，支原体感染的分泌物通常较稀薄，衣原体感染的分泌物有时呈浆液性，早晨起床时可能发现尿道口有少量分泌物粘连，即“糊口”现象。
可能引发的并发症
附睾炎：如果支原体或衣原体感染未及时控制，可能引发附睾炎。患者会出现阴囊部位疼痛、肿胀，触摸时疼痛明显，严重时会影响睾丸的正常功能。前列腺炎：也可能导致前列腺炎，表现为会阴部坠胀、疼痛，排尿时可能有尿频、尿急、尿痛等症状，还可能影响精液质量，对生育有一定影响。
与其他疾病症状的区别
与淋病的区别：淋病引起的尿道分泌物一般较多，呈脓性，而支原体、衣原体感染的分泌物相对较少且稀薄。与非淋菌性尿道炎的关系：支原体、衣原体感染是非淋菌性尿道炎的主要致病因素之一，非淋菌性尿道炎的症状与支原体、衣原体感染的症状有相似之处，但非淋菌性尿道炎还可能由其他病原体引起，不过支原体和衣原体是其中常见的原因。